Acanthomyites (1)
Achanthiptera (1)
Aethiopomyia (5)
Afromydaea (2)
Agenamyia (2)
Albertinella (1)
Alluaudinella (6)
Altimyia (1)
Amicitia (4)
Anaphalantus (1)
Andersonosia (2)
Anthocoenosia (1)
Apsil (12)
Archaeopolietes (1)
Arthurella (2)
Atelia (1)
Atherigona (Rice stem fly) (308)
Auria (1)
Australophyra (1)
Azelia (21)
Balioglutum (1)
Beccimyia (1)
Bigotomyia (1)
Biopyrellia (1)
Bithoracochaeta (14)
Brachygasterina (11)
Brevicosta (1)
Brontaea (2)
Bruceomyia (1)
Bryantina (1)
Buccophaonia (1)
Callainireinwardtia (1)
Calliphoroides (1)
Calythea (1)
Camptotarsopoda (5)
Caricea (37)
Cariocamyia (3)
Cephalispa (31)
Chaetagenia (5)
Chaetopapuaia (1)
Chaetophaonia (2)
Charadrella (3)
Chortinus (2)
Chuntiania (2)
Coenosia (484)
Cordiluroides (7)
Correntosia (1)
Crucianella (1)
Cryptochaetum (7)
Curranosia (13)
Cypselodopteryx (1)
Cyrtoneurina (47)
Cyrtoneuropsis (9)
Dasymorellia (1)
Dasyphora (31)
Deltotus (3)
Dexiopsis (4)
Dichaetomyia (327)
Dimorphia (5)
Dolichophaonia (9)
Drepanocnemis (5)
Drymeia (120)
Eginia (1)
Eginiella (1)
Eudasyphora (10)
Exsul (3)
Fraserella (2)
Graphomya (59)
Gymnodia (54)
Gymnopapuaia (26)
Gymodia (1)
Haematobia (Horn fly) (9)
Haematobosca (20)
Haematostoma (1)
Haroldopsis (1)
Hebecnema (38)
Helana (1)
Helina (672)
Helinomydaea (4)
Heliographa (23)
Hemichlora (2)
Hennigiola (1)
Hennigmyia (4)
Huckettomyia (3)
Hybomitra (1)
Hydrotaea (167)
Idiohelina (3)
Insulamyia (1)
Itatingamyia (2)
Lasiopelta (8)
Limnohelina (10)
Limnophora (408)
Limnospila (2)
Lispacoenosia (1)
Lispe (224)
Lispocephala (163)
Lispoides (17)
Lophosceles (7)
Macroeginia (1)
Macrorchis (4)
Magma (1)
Megophyra (14)
Mesembrina (14)
Metopomyia (1)
Microcalyptra (3)
Micropotamia (2)
Mitroplatia (16)
Morella (3)
Morellia (75)
Mulfordia (3)
Musca (130)
Muscidae (1)
Muscina (False stable fly) (15)
Mydaea (116)
Myiophaea (1)
Myospila (152)
Neivamyia (5)
Neodexiopsis (97)
Neohelina (2)
Neohydrotaea (2)
Neolimnophora (2)
Neomuscina (42)
Neomyia (86)
Neorypellia (2)
Neurotrixa (4)
Nexodexiopsis (1)
Notoschoenomyza (9)
Nystomyia (1)
Ochromusca (2)
Ocypodomyia (2)
Ophya (1)
Ophyra (11)
Opsolasia (1)
Orchisia (2)
Orthellia (1)
Oxytonocera (1)
Pachyceramyia (6)
Paleostomoxys (1)
Palpibracus (21)
Palpilongus (1)
Papuaia (5)
Papuaiella (1)
Paracoenosia (2)
Paralimnophora (3)
Parastomoxys (1)
Parvisquama (15)
Passeromyia (6)
Pectiniseta (10)
Pentacricia (1)
Phaomusca (1)
Phaonia (785)
Phaonidia (1)
Phaonina (1)
Philornis (50)   (1)
Pictia (1)
Pilispina (8)
Plexiopsis (1)
Plumispina (1)
Polietes (14)
Polietina (14)
Polletella (2)
Potamia (7)
Prohardyia (5)
Prostomoxys (1)
Pseudocoenosia (8)
Pseudohelina (10)
Pseudoptilolepis (12)
Psilochaeta (7)
Pygophora (81)
Pyrellia (27)
Pyrellina (14)
Reinwardtia (2)
Reynoldsia (9)
Rhabdoptera (1)
Rhinomusca (2)
Rhynchomydaea (1)
Rypellia (8)
Sarcopromusca (3)
Scenetes (1)
Schoenomyza (24)
Schoenomyzina (6)
Scutellomusca (2)
Sinophaonia (1)
Souzalopesmyia (6)
Spanochaeta (2)
Spathipheromyia (15)
Spilogaster (1)
Spilogona (304)
Stomopogon (8)
Stomoxys (20)
Stygeromyia (2)
Sumapazomyia (2)
Syllimnophora (34)
Syngamoptera (11)
Synthesiomyia (2)
Tamilomyia (1)
Tapantiomyia (1)
Tertiuseginia (1)
Tetramerinx (7)
Thaumasiochaeta (8)
Thricops (55)
Trichomorellia (9)
Villeneuvia (1)
Xenomorellia (2)
Xenomyia (16)
Xenotachina (24)
Xenothoracochaeta (1)
Xestomyia (5)

(...) = Species count
(...) = Endangered count
(...) = Invasive count